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vector nti advance 11

v11.5.4 免費版 vector nti advance 11 網(wǎng)友評分:8

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軟件標(biāo)簽: vectornti 行業(yè)軟件

vector nti 11.5是一款在生物行業(yè)中廣泛運用的工具,為你帶來最便捷的生物分析分析工,輕松的對各類生物元素進(jìn)行最全面最細(xì)致的分析,同時能夠得到點陣關(guān)系圖,快速進(jìn)行基因匹配等功能,快來綠色資源網(wǎng)下載吧!

vector nti 11官方介紹

vector nti advance在序列對比、蛋白質(zhì)研究、基因分析等方面也是可以使用的,為生物學(xué)研究人士提供一個可以計算的實驗平臺。在生物數(shù)據(jù)分析上的使用是非常廣泛的,其提供的四個分析模塊可以針對DNA、限制酶、引物分析、蛋白質(zhì)等類型的生物數(shù)據(jù)進(jìn)行詳細(xì)模擬和演化分析,您可以將自己的實驗數(shù)據(jù)加載到軟件中,創(chuàng)建一個可以持續(xù)分析的實驗?zāi)M過程,在不同的實驗階段輸入得到的數(shù)據(jù),通過掌控數(shù)據(jù)參數(shù)的方式讓分子不斷進(jìn)化,從而對未來的生物數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)測和判斷分析;

vector nti 11軟件特色

從AlignX出口分子

在文本窗格中選定的分子可以出口到GenBank、EMBL(GenPept蛋白質(zhì))(SWISS-PROT蛋白質(zhì)),或為原序列fasta文件。若要將分子導(dǎo)出到外部文件,請選擇項目>導(dǎo)出分子,并在“文件保存”對話框中選擇文件類型。

得分矩陣-- AlignX

設(shè)計成對序列比對評估的所有算法都是基于將分?jǐn)?shù)分配給對齊殘基的系統(tǒng),檢測不同序列之間的相似性。眾所周知,某些氨基酸在其他相關(guān)蛋白質(zhì)中很容易被其他氨基酸取代,這可能是因為它們具有相似的理化性質(zhì)。根據(jù)氨基酸被替換為原始?xì)埢南嗨菩?,這些“替換”被分配在矩陣中顯示的分?jǐn)?shù)。在對齊分?jǐn)?shù)上相同或相似的殘留物比那些不太相似的殘留物高

比對pcr分析報告

當(dāng)搜索完成時,如果您在結(jié)果選項卡上檢查了生成報告選項,則對齊PCR報告預(yù)覽窗口顯示分析結(jié)果。比對PCR分析報告對話框的外觀和功能類似于多重PCR分析報告對話框。

關(guān)于點陣

點陣分析主要是比較兩個序列來尋找所有可能的殘基匹配的方法。該方法還可用于蛋白質(zhì)和DNA序列中的直接或反向重復(fù)序列。它可以預(yù)測RNA中自我互補的區(qū)域,從而形成雙鏈區(qū)或二級結(jié)構(gòu)。

分析bioannotator

bioannotator是一套全面的蛋白質(zhì)和核酸序列分析工具,超過五十種不同的預(yù)定義的蛋白表與特征映射和序列提供。bioannotator還提供以下先進(jìn)的搜索和分析工具,它是運行在分析監(jiān)控:PROSITE,Pfam,塊和蛋白水解裂解。

通過Web執(zhí)行分析

Vector NTI使得它很容易把你的alignx數(shù)據(jù)直接到公共網(wǎng)站已經(jīng)建立了一個分子的三維結(jié)構(gòu),比較它與其他分子,特定功能的搜索,或進(jìn)行基因預(yù)測,等等。

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分析GenomBench

genombench是Vector NTI提前的基因組項目的主力。genombench可以容納一個堿基的基因組片段,可以檢索從兼容的系統(tǒng)兼容的服務(wù)器上的數(shù)據(jù),例如UCSC和Ensembl。它提供了瀏覽和查詢這些網(wǎng)站使用關(guān)鍵詞,界面兩側(cè)標(biāo)記,BLAT(UCSC數(shù)據(jù)庫)或SSAHA(的)。genombench還提供以下先進(jìn)的搜索和分析工具,它是運行在分析監(jiān)控

對分子序列的操作

我們以一個DNA序列為例,進(jìn)行一系列的常規(guī)分析;最后將此DNA序列翻譯成氨基酸序列,并對此氨基酸序列進(jìn)行各種分析。

對齊顯示設(shè)置——Consensus Calculation Tab

一致性序列是一個理論上有代表性的核苷酸序列,其中每個核苷酸代表在同一位點上在同一位點上經(jīng)常看到的殘基,或由其他標(biāo)準(zhǔn)選擇?!皩R設(shè)置”對話框中的“一致性計算”選項卡指定如何以對齊方式計算對齊窗格中作為底部序列的一致序列。

以點擊作為特征輸出查詢分子

當(dāng)您導(dǎo)出查詢顯示為特征的分子打成。GFF文件,使用點擊功能GFF文件命令導(dǎo)出查詢分子保存。GFF文件到外部位置(硬盤、軟盤、網(wǎng)絡(luò)等)。你可以打開一個。在一個Vector NTI分子視窗GFF文件并將其保存到Vector NTI數(shù)據(jù)庫,如果需要的話。。GFF文件提供一個共享查詢爆破方法打信息與其他Vector NTI用戶分子格式。

模擬電泳

模擬電泳是指對DNA片段進(jìn)行酶切分析后,通過電腦模擬電泳過程,將酶切片段分離。該功能有利于評估電泳時間,便于驗證實際電泳結(jié)果的好壞。

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使用說明

圖案設(shè)置

選中“圖案”復(fù)選框,在“顯示設(shè)置”對話框中激活“圖案設(shè)置”按鈕,打開控制圖標(biāo)顯示的“圖形設(shè)置”對話框。此對話框中可用的選項根據(jù)打開盒子的源分子類型而有所不同。

示設(shè)置功能

在顯示設(shè)置對話框,檢查個復(fù)選框,按框設(shè)置”按鈕來指定如何開放閱讀框ORF顯示打開設(shè)置對話框。

·檢查嵌套框復(fù)選框查找嵌套ORFs(具有相同的終止密碼子,但不同的起始密碼子,ORF)

·在起始密碼子和終止密碼子字段,輸入起始密碼子和終止密碼子為新觀眾的ORFs。按默認(rèn)的啟動和停止按鈕來設(shè)置起始密碼子和終止密碼子的傳統(tǒng)價值觀:起始密碼子ATG、GTG;終止密碼子TAA,TGA,標(biāo)簽。

·在最小ORF大小字段中,輸入密碼子中最小的ORF大小。

工具管理器

要打開工具管理器,請單擊工具>工具管理器。

有關(guān)使用工具管理器的信息,請按F1命令從該對話框打開聯(lián)機(jī)幫助。

工具管理器是一個Vector NTI回顧描述目前注冊工具或創(chuàng)建新的工具或鏈接工具和現(xiàn)有的工具進(jìn)行現(xiàn)有業(yè)務(wù)信息輔助應(yīng)用。

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