- 軟件大小:176.75M
- 軟件語(yǔ)言:中文
- 軟件類型:國(guó)外軟件
- 軟件類別:修改軟件 / 其他行業(yè)
- 更新時(shí)間:2023-03-17 18:41
- 運(yùn)行環(huán)境:WinAll, WinXP, Win7, Win8
- 軟件等級(jí):
- 軟件廠商:
- 官方網(wǎng)站:暫無(wú)
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vector nti 11.5是一款在生物行業(yè)中廣泛運(yùn)用的工具,為你帶來(lái)最便捷的生物分析分析工,輕松的對(duì)各類生物元素進(jìn)行最全面最細(xì)致的分析,同時(shí)能夠得到點(diǎn)陣關(guān)系圖,快速進(jìn)行基因匹配等功能,快來(lái)綠色資源網(wǎng)下載吧!
vector nti advance在序列對(duì)比、蛋白質(zhì)研究、基因分析等方面也是可以使用的,為生物學(xué)研究人士提供一個(gè)可以計(jì)算的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。在生物數(shù)據(jù)分析上的使用是非常廣泛的,其提供的四個(gè)分析模塊可以針對(duì)DNA、限制酶、引物分析、蛋白質(zhì)等類型的生物數(shù)據(jù)進(jìn)行詳細(xì)模擬和演化分析,您可以將自己的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)加載到軟件中,創(chuàng)建一個(gè)可以持續(xù)分析的實(shí)驗(yàn)?zāi)M過(guò)程,在不同的實(shí)驗(yàn)階段輸入得到的數(shù)據(jù),通過(guò)掌控?cái)?shù)據(jù)參數(shù)的方式讓分子不斷進(jìn)化,從而對(duì)未來(lái)的生物數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)測(cè)和判斷分析;
從AlignX出口分子
在文本窗格中選定的分子可以出口到GenBank、EMBL(GenPept蛋白質(zhì))(SWISS-PROT蛋白質(zhì)),或?yàn)樵蛄衒asta文件。若要將分子導(dǎo)出到外部文件,請(qǐng)選擇項(xiàng)目>導(dǎo)出分子,并在“文件保存”對(duì)話框中選擇文件類型。
得分矩陣-- AlignX
設(shè)計(jì)成對(duì)序列比對(duì)評(píng)估的所有算法都是基于將分?jǐn)?shù)分配給對(duì)齊殘基的系統(tǒng),檢測(cè)不同序列之間的相似性。眾所周知,某些氨基酸在其他相關(guān)蛋白質(zhì)中很容易被其他氨基酸取代,這可能是因?yàn)樗鼈兙哂邢嗨频睦砘再|(zhì)。根據(jù)氨基酸被替換為原始?xì)埢南嗨菩?,這些“替換”被分配在矩陣中顯示的分?jǐn)?shù)。在對(duì)齊分?jǐn)?shù)上相同或相似的殘留物比那些不太相似的殘留物高
比對(duì)pcr分析報(bào)告
當(dāng)搜索完成時(shí),如果您在結(jié)果選項(xiàng)卡上檢查了生成報(bào)告選項(xiàng),則對(duì)齊PCR報(bào)告預(yù)覽窗口顯示分析結(jié)果。比對(duì)PCR分析報(bào)告對(duì)話框的外觀和功能類似于多重PCR分析報(bào)告對(duì)話框。
關(guān)于點(diǎn)陣
點(diǎn)陣分析主要是比較兩個(gè)序列來(lái)尋找所有可能的殘基匹配的方法。該方法還可用于蛋白質(zhì)和DNA序列中的直接或反向重復(fù)序列。它可以預(yù)測(cè)RNA中自我互補(bǔ)的區(qū)域,從而形成雙鏈區(qū)或二級(jí)結(jié)構(gòu)。
分析bioannotator
bioannotator是一套全面的蛋白質(zhì)和核酸序列分析工具,超過(guò)五十種不同的預(yù)定義的蛋白表與特征映射和序列提供。bioannotator還提供以下先進(jìn)的搜索和分析工具,它是運(yùn)行在分析監(jiān)控:PROSITE,Pfam,塊和蛋白水解裂解。
通過(guò)Web執(zhí)行分析
Vector NTI使得它很容易把你的alignx數(shù)據(jù)直接到公共網(wǎng)站已經(jīng)建立了一個(gè)分子的三維結(jié)構(gòu),比較它與其他分子,特定功能的搜索,或進(jìn)行基因預(yù)測(cè),等等。
分析GenomBench
genombench是Vector NTI提前的基因組項(xiàng)目的主力。genombench可以容納一個(gè)堿基的基因組片段,可以檢索從兼容的系統(tǒng)兼容的服務(wù)器上的數(shù)據(jù),例如UCSC和Ensembl。它提供了瀏覽和查詢這些網(wǎng)站使用關(guān)鍵詞,界面兩側(cè)標(biāo)記,BLAT(UCSC數(shù)據(jù)庫(kù))或SSAHA(的)。genombench還提供以下先進(jìn)的搜索和分析工具,它是運(yùn)行在分析監(jiān)控
對(duì)分子序列的操作
我們以一個(gè)DNA序列為例,進(jìn)行一系列的常規(guī)分析;最后將此DNA序列翻譯成氨基酸序列,并對(duì)此氨基酸序列進(jìn)行各種分析。
對(duì)齊顯示設(shè)置——Consensus Calculation Tab
一致性序列是一個(gè)理論上有代表性的核苷酸序列,其中每個(gè)核苷酸代表在同一位點(diǎn)上在同一位點(diǎn)上經(jīng)??吹降臍埢蛴善渌麡?biāo)準(zhǔn)選擇?!皩?duì)齊設(shè)置”對(duì)話框中的“一致性計(jì)算”選項(xiàng)卡指定如何以對(duì)齊方式計(jì)算對(duì)齊窗格中作為底部序列的一致序列。
以點(diǎn)擊作為特征輸出查詢分子
當(dāng)您導(dǎo)出查詢顯示為特征的分子打成。GFF文件,使用點(diǎn)擊功能GFF文件命令導(dǎo)出查詢分子保存。GFF文件到外部位置(硬盤、軟盤、網(wǎng)絡(luò)等)。你可以打開一個(gè)。在一個(gè)Vector NTI分子視窗GFF文件并將其保存到Vector NTI數(shù)據(jù)庫(kù),如果需要的話。。GFF文件提供一個(gè)共享查詢爆破方法打信息與其他Vector NTI用戶分子格式。
模擬電泳
模擬電泳是指對(duì)DNA片段進(jìn)行酶切分析后,通過(guò)電腦模擬電泳過(guò)程,將酶切片段分離。該功能有利于評(píng)估電泳時(shí)間,便于驗(yàn)證實(shí)際電泳結(jié)果的好壞。
圖案設(shè)置
選中“圖案”復(fù)選框,在“顯示設(shè)置”對(duì)話框中激活“圖案設(shè)置”按鈕,打開控制圖標(biāo)顯示的“圖形設(shè)置”對(duì)話框。此對(duì)話框中可用的選項(xiàng)根據(jù)打開盒子的源分子類型而有所不同。
示設(shè)置功能
在顯示設(shè)置對(duì)話框,檢查個(gè)復(fù)選框,按框設(shè)置”按鈕來(lái)指定如何開放閱讀框ORF顯示打開設(shè)置對(duì)話框。
·檢查嵌套框復(fù)選框查找嵌套ORFs(具有相同的終止密碼子,但不同的起始密碼子,ORF)
·在起始密碼子和終止密碼子字段,輸入起始密碼子和終止密碼子為新觀眾的ORFs。按默認(rèn)的啟動(dòng)和停止按鈕來(lái)設(shè)置起始密碼子和終止密碼子的傳統(tǒng)價(jià)值觀:起始密碼子ATG、GTG;終止密碼子TAA,TGA,標(biāo)簽。
·在最小ORF大小字段中,輸入密碼子中最小的ORF大小。
工具管理器
要打開工具管理器,請(qǐng)單擊工具>工具管理器。
有關(guān)使用工具管理器的信息,請(qǐng)按F1命令從該對(duì)話框打開聯(lián)機(jī)幫助。
工具管理器是一個(gè)Vector NTI回顧描述目前注冊(cè)工具或創(chuàng)建新的工具或鏈接工具和現(xiàn)有的工具進(jìn)行現(xiàn)有業(yè)務(wù)信息輔助應(yīng)用。
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